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我国是一个传统的农业大国， 农业是国民经济的基础，在计划经济时期我国对农产品实行严格的控制。进入市场化改革以后，国家逐步放开了农产品的价格，但又担心农产品价格剧烈波动会影响国家的稳定，因此倾向于对大宗农产品进行价格管理。虽然粮食流通体制是朝着市场化方向进行改革，但由于国家保护价制度是通过国有粮食企业进行的，这就使国有粮食企业行政化，由这些行政化的企业博弈产生的价格是不完全的。因此，我国农产品期货市场上存在的问题有以下几点：
(1)我国农产品现货市场发育不完善
价格的市场化是期货市场发展的生命源，在价格不能完全市场化的条件下开展期货交易，只会影响期货市场功能的发挥。政府干预农产品现货市场价格的目的是为了使价格保持在一个相对平稳的空间。如果商品的价格缺乏波动性，投机者就缺乏投机的动力；但如果价格波动剧烈，政府就会直接干预市场，影响市场价格的有效形成，给投机者带来政策风险。
在现行的粮食流通体制下，国有粮食企业是按国家的规定实行顺价销售，实际上粮价是固定的，粮食生产经营者和投机者都没有进行粮食期货交易的需求和欲望，使期货市场的发展缺乏动力。
(2)农产品期货市场上市品种单一、种类简单
我国期货市场试点初期，曾经上市的农产品期货达20多种，但由于风险事件频发以及当时的宏观经济环境的影响，大部分期货品种退出了期货市场。经过治理调整，我国期货市场保留的期货品种有12种，分布在三家交易所，而实际上市的期货品种只有7种，相当于CBT上市品种的8%。
(3)期货市场主体相关知识缺乏
期货市场在我国已经建立了20多年，但广大投资者依然对期货市场了解不多，把期货和股票进行同样的操作，使投资者面临很大的风险。并且由于前几年期货市场萎缩，期货市场专业人才流失严重，很多生产经营性企业缺乏专业的的期货分析和管理人员，使企业的经营风险加大。
(4)谨慎发展政策约束了期货市场的发展
由于我国在期货市场建立初期盲目发展，市场很不规范，产生了很大的风险。期货市场政策的制定一直坚持谨慎、从严的原则，注重规范与稳定，这对控制期货市场的风险和整顿期货市场是很有成效的，但在期货市场稳步发展时期就会束缚住期货市场的发展。例如，限制国有企业进行套期保值业务，限制期货经纪公司的业务，对作为保证金的资金来源做了很严格的限制，这些限制现在已经对期货市场的发展产生了很大的阻力。
(5)农产品期货市场主体缺失
一国期货市场的主体应包括套期保值者、投机者，农产品期货市场的套期保值者应包括农业生产者、生产经营者和农产品加工企业。但我国的国有粮食企业和农民由于自身和政策的原因都还没有成为期货市场的主体，这就使我国的农产品期货市场参与主体不全。
